办理招标涉密资质需要遵循以下流程和注意事项：

准备材料

根据国家规定的程序，准备企业基本情况、专业技术人员名单、办公设施设备情况、业务经验和业绩证明等材料。

提交申请

向当地建设行政主管部门提交申请材料，如营业执照、专业技术人员证书、办公设施证明等。

审核和评审

经过审核和评审环节，确保申请材料的真实性和完整性。

公示

通过审核后，进行公示，若无异议，则可获得资质。

年检要求

每年都需要进行资质年检，以确保企业的运营状况符合国家规定，逾期未检将面临处罚甚至撤销资质。

小型项目

小型项目可能只需符合当地建设行政主管部门的规定，或者采用简易程序进行。

法律依据

《涉密信息系统集成资质管理办法》第六条规定，国家保密行政管理部门主管全国涉密集成资质管理工作，省级保密行政管理部门主管本行政区域内涉密集成资质管理工作。

办理流程

定密、建保密制度、保密室建设、提交申请、模拟审查、现场审查等步骤。

申请条件

需满足国内注册、良好信誉、专业能力等要求，并依据《涉密信息系统集成资质管理办法》进行审查和建议。

提交材料

包括《涉密信息系统集成资质申请书》、企业营业执照或事业单位法人证书、章程、法定代表人、主要负责人、实际控制人、董（监）事会人员、高级管理人员以及从事涉密集成业务的其他人员情况、资本结构和股权情况、生产经营和办公场所产权证书或者租赁合同、近三年集成业务合同清单、涉密集成业务场所和保密设施、设备情况、基本管理制度、保密制度以及保密体系运行情况等。

审查与发证

保密行政管理部门收到申请材料后，应当在五日内完成审查，申请材料齐全且符合法定形式的，应当受理并发出受理通知书，申请材料不齐全或者不符合法定形式的，应当一次告知申请单位十五日内补正材料，逾期未告知申请单位补正的，自收到申请材料之日起即为受理，申请单位十五日内不予补正的，视为放弃本次行政许可申请。

建议：

申请单位应提前了解相关政策和标准，确保自身条件符合要求。

建立完善的保密管理制度，并加强员工保密意识和技能的培养。

选择具有权威性和公信力的认证机构进行保密资质的认证。

准备好所有必要的证明材料，并按照规定的流程进行申请。