大专学校通常根据教育部的专业分类来设置系部和专业。根据2015年教育部公布的《普通高等学校高等职业教育（专科）专业目录》，高职（专科）的专业分为三级，其中第一级为专业大类，共计有19个专业大类。这些专业大类涵盖了广泛的领域，如农林牧渔、资源环境与安全、能源动力与材料、土木建筑、水利、装备制造、生物与化工、轻工纺织、食品药品与粮食、交通运输、电子信息、医药卫生、财经商贸、旅游、文化艺术、新闻传播、教育与体育、公安与司法、公共管理与服务等。

每个专业大类下，大专学校可能会设置不同的系部来组织和实施教学。例如，湖南中医药高等专科学校设有医学系、护理系、药学系、康复保健系、思政与公共课部、继续教育部等六个系部。而青岛职业技术学院有38个专业，分为不同的系部，并且拥有“3+2”对口贯通专科与本科分段培养试点专业。

不同的专科学校根据其特色和定位，系部的设置可能会有所不同。系部是实施专业教学和管理的基本单位，通常负责制定和执行教学计划、组织教学活动、进行科研等。

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